1、PubChem
官网:http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov
PubChem 检索可获得的功效包括了份子式、SMILES、2D和3D机关、InChI和InChIKey、相对份子质量、脂水份派系数、氢键受体和供体数目、可扭转键数目、互变异构体数目等底子的机关信息和物化性质,除此之外,还有该化合物作为药物的剂型和商品信息、药理性质、毒性、生物活性检测等信息,并经过文献分类副题目可以检察相关文献。
PubChem数据库于2004年正式对方开放利用,这是一个可免得费获得利用的数据库,其中包括了很多与有机小份子化学机关及其生物活性相关的信息。它包括了机关、命名和计较物理化学数据,并与NIH PubMed/ Entrez信息链接。
PubChem的数据信息被分别红三个相互关联的数据库,即PubChem Substance、PubChem Compound和PubChem BioAssay,这三个数据库都隶属于NCBI的Entrez信息检索系统。
2、ChemSpider
官网:http://www.chemspider.com/
ChemSpider是一个隶属于英国皇家化学会的汇总数据库,包括了来自分歧资本供给的五千五百多个化合物信息。现在,该数据库含有的信息包含陆地自然产物数据、ACD尝试室化学数据库、EPA的DSSTox数据库以及来自分歧供给商的一系列化学物资信息。数据库具有多种搜索工具,而且大大都化合物都有计较物理化学性质值。
数据库供给以下查询方式:标准查询方式包含系统称号、贸易称号和同义词、挂号号查询;高级查询方式供给互动式搜索,经过化合物机关、化合物子机关,份子式以及份子量、CAS编号、供给商等停止高级搜索。还可以对搜索获得的功效停止进一进步的挑选以限制更小的搜索范围;ChemSpider还供给以iOS软件利用(iPhone/iPod/iPad)为平台的移动装备搜索。同时也支撑安卓系统。
3、Phenol-Explorer
官网:http://phenol-explorer.eu/
Phenol-Explorer是第一个专门为食品中多酚含量建立的综合数据库。数据库中含有400种食品中500个分歧多酚类物资的35,000多个含量值。这些数据信息是从1,300多篇科学文献傍边说起的60,000多种原始含量值中提取而来。在从论文提取数据之前,每一篇论文都经过了严酷认真的检查和评价。用户可以查询经过各类分析方式判定获得的食品、多酚和代谢物。
4、ZINC
官网:http://zinc.docking.org
包括2000多万个化合物份子,适用于虚拟挑选。经过ZINCID、SMILES格式等停止检索,检索功效中给出了化合物的机关,一些化合物的重要性质,包含xlogP,消融度,氢键给体和受体数目等,以及二维和三维机关,供给商信息。用户可以自行绘制或输入份子的SMILES字符串来上传待检索的份子,同时,还可以限制净电荷量、xLogP、可扭转键数、氢键供体和受体数等参数范围。库中的份子机关都可被免费下载,支撑SMILES、mol2、3DSDF和DOCK flexibase格式,而且化合物的相关信息可以以表格形式下载,便于用户利用。
5、DrugBank
官网:http://www.drugbank.ca
该数据库是一个配合的生物信息学和化学信息资本相连系的药物和药物靶标数据库。该数据库包含8206个药物条目,包含1991个FDA核准的小份子药物,207个FDA核准的生物技术(卵白/肽)的药物,93个营养品和6000的尝试药物。此外,4333个非冗余卵白质(即药物靶标/酶/转运体/)序列被链接到这些药物条目上。
药物信息包含了该药物的CAS号、商品名、份子式、份子量、SMILES、2D和3D机关、logP、logS、pKa、熔点、吸收性、Caco-2细胞穿透性、药物种别和临床利用、性质描写、剂型与给药路子、半衰期、体内的生物转化、毒性、感化于哪些生物体、食品对服用的影响、与别的药物的相互感化、感化机理、代谢路子、药理学特征、与卵白质的连系情况、消融度、物资形状、同义词、关于分解的相关文献等,还与ChEBI、GenBank、PubChem等内部数据库有链接。
6、Toxnet
官网:http://toxnet.nlm.nih.gov/
Toxnet是美国国家医学图书馆(nlm)的化合物毒性相关数据库,包含药品毒理学、危险化学品和别的相关范畴的信息,从Toxnet可对以下子数据库停止检索:
HSDB (危险化合物数据库):内含4500种毒性(或能够具有毒性的)化学药品,以及其毒性、对情况的影响、化学安好性、烧毁物处置等相关范畴的信息。
TOXLINE® :包含药物和别的化学物资的生物化学、药理学、心理学、毒理学的文献数据库。其中有300万条引文、几近都有摘要和/或检索条、以及CA登录号。
ChemIDplus :对NLM数据库中的化学物资供给机关式和专业信息。
7、Drug future
官网:http://www.drugfuture.com/toxic/
RTECS首要包含以下六大类化学物资的毒性数据:间接刺激性(Primary irritation);致突变性(Mutagenic effects);对生殖的影响(Reproductive effects,即致畸性);致肿瘤性(Tumorigenic effects);急性毒性(Acute toxicity);其他多剂量毒性。
其中记录有该化学物资的数值毒性值,如对折致死量(LD50或LC50),最低中毒剂量(TDLo),最低中毒浓度(TCLo)等,以及尝试所利用的物种和给药路子。除此之外,一切的数据也都列出了其文献来历,但是并没有对其有任何的评价。
该数据库中数据大部分都较为久远,一些较新的化合物不被列入;此外,此数据库查询时会有一些bug,如需查询一个化合物,最好经过度歧方式如CAS号,通用名屡次查询,由于有些化合物能够通用名查不到,CAS号却能查到。
8、ChemBlink
官网:http://www.chemblink.com/indexC.htm#opennewwindow
首页检索(该数据库检索与Drug future-化学物资毒性数据库类似,需经过CAS号和化学名等屡次检索,偶然辰CAS号搜不出来,化学名可以,以下面CAS号搜索没有功效,可是用化学名Tetrabutylammonium bromide就可以获得功效):供给化合物的安好技术说明书(MSDS),说明书中毒性一栏(Toxicological Information)会供给化合物的一些毒性数据。
9、Chemical Book
官网:http://www.chemicalbook.com/
ChemicalBook是一家努力于为化学行业用户供给最有代价信息的资本平台,平台可以利用利用中文称号,CAS号,英文称号,份子式,份子量,MDL号,EINECS号,机关式等多种方式检索,供给供化合物的安好技术说明书(MSDS),说明书中毒性一栏(Toxicological Information)会供给化合物的一些毒性数据。
10.StoneMIND Collector-化学机关极速识别软件
能很快、很正确地识别文献和专利中的份子机关式,对多元杂环,手性份子,自然产物等识别正确度很高。只需截图,就能敏捷完成识别和输出份子的SMILES和MOL式,而且MOL和SMILES式能在众多化学编辑器中通用,经过粘贴的方式即可获得所需要的份子机关式,用起来出格的便当~
(文章素材来历:化学数据同盟) |